El Tribunal Universitario del ITESO es un organismo colegiado que tiene la función de dirimir los conflictos o resolver los reclamos y controversias que se sometan a su conocimiento por parte de las autoridades universitarias o los integrantes de la comunidad universitaria.
Se encuentra conformado por tres integrantes y un suplente. Su actuación está restringida al ámbito interno de la universidad, siendo la última instancia para resolver conflictos. Sus resoluciones son inapelables.